החינוך הבלתי פורמאלי הוא הנשמה היתרה של החינוך.
המועצה והיישובים מקיימים מערכת חינוך בלתי פורמאלי לילדים ולנוער, שמטפחת חינוך ערכי – קהילתי ואזורי לילדים ולהוריהם בשעות הפנאי, ימי שישי וחופשות.
כ- 3000 ילדים ונוער שותפים למסגרת חינוכית זו ב-29 יישובי המועצה והם נפגשים לפעילות חברתית-קהילתית מגוונת ומלאת תוכן, במועדוני הנוער ובחברות הילדים, במסגרת הפעלות מקומיות ואזוריות ובקייטנות שמארגנת המועצה. המחלקה פועלת להרחבת פעילות הילדים והנוער באזור, ליצירת מעגלי פעילות ולטיפוח התנדבות הנוער למען עצמו וסביבתו.
באמצעות מרכז ההדרכה השוכן בבי"ס "הר וגיא" בדפנה וצוות מקצועי, מלווה המועצה ומנחה את צוותי החינוך הבלתי פורמאלי בקיבוצים: רכזי חינוך, מדריכי כיתות יסוד ומדריכי נוער. המחלקה פעילה בתוך הקיבוצים במתן תמיכה כספית, בהדרכה ע"פ סטנדרטים שמבטיחים איכות, סבסוד קייטנות והשתתפות חניכים בפרויקטים ובמפעלים מיוחדים.