היחידה הסביבתית של המועצה ארגנה וחילקה את בתי הספר לפי הנחלים באזור. תלמידי הגומא ניקו לאורך הירדן, תלמידי מבוא הגליל ניקו את אזור החניה בעין טינה, תלמידי לב העמק ניקו יחד עם עובדי מפעל טבע נאות באזור המפעל, את חניון גשר להבות הבשן, ולאורך התעלה המזרחית. גם הגדולים השתתפו במלאכה - עינות ירדן ניקו באזור סכר כפר בלום, ושאר בתי הספר ניקו בשטח בית הספר ובסביבותיו. מלבד מבצעי הניקיון, עסקו בתי הספר בנושא הניקיון ברשות הרבים, שמירה על הניקיון במרחב הציבורי, ובהפרדת פסולת.